Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms