Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms