Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC4Q8N9L1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms