Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNTD1Q8N815 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms