Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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TMCO5AQ8N6Q1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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TMCO5AQ8N6Q1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TMCO5AQ8N6Q1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TMCO5AQ8N6Q1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCO5AQ8N6Q1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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