Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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