Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms