Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBRM1Q86U86 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms