Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms