Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP54Q7Z3B4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms