Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY3Q7L099 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms