Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms