Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms