Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms