Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ASCL4Q6XD76 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms