Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG9

LRFN4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN4Q6PJG9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRFN4Q6PJG9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms