Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFCAB12Q6NXP0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms