Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF544Q6NX49 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms