Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LCN10Q6JVE6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms