Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRAMD4Q6IC98 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms