Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECM29Q5VYK3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms