Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP6Q5VW22 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms