Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms