Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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