Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C10orf55Q5SWW7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms