Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMER1Q5JTC6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms