Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SDK2Q58EX2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms