Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms