Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACSM3Q53FZ2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACSM3Q53FZ2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms