Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM259Q4ZIN3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms