Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDNFQ49AH0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms