Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms