Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC96Q2M329 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC96Q2M329 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms