Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms