Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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