Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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CCDC142Q17RM4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC142Q17RM4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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CCDC142Q17RM4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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CCDC142Q17RM4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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CCDC142Q17RM4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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CCDC142Q17RM4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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CCDC142Q17RM4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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CCDC142Q17RM4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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