Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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