Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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