Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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