Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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SNAPC1Q16533 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPC1Q16533 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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SNAPC1Q16533 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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