Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITSN1Q15811 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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