Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CEBPEQ15744 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEBPEQ15744 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms