Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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