Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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SEC23BQ15437 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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SEC23BQ15437 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC23BQ15437 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
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