Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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