Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RYR3Q15413 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms