Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBE3CQ15386 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3CQ15386 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3CQ15386 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE3CQ15386 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms