Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms