Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCAPD2Q15021 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPD2Q15021 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPD2Q15021 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPD2Q15021 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPD2Q15021 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPD2Q15021 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPD2Q15021 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPD2Q15021 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPD2Q15021 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPD2Q15021 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPD2Q15021 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPD2Q15021 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPD2Q15021 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPD2Q15021 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPD2Q15021 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPD2Q15021 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPD2Q15021 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPD2Q15021 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPD2Q15021 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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