Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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UBE4AQ14139 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
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UBE4AQ14139 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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UBE4AQ14139 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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UBE4AQ14139 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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UBE4AQ14139 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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UBE4AQ14139 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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UBE4AQ14139 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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UBE4AQ14139 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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UBE4AQ14139 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
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